Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6aO35464 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6aO35464 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6aO35464 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema6aO35464 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema6aO35464 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema6aO35464 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6aO35464 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6aO35464 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6aO35464 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema6aO35464 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema6aO35464 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6aO35464 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema6aO35464 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema6aO35464 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema6aO35464 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema6aO35464 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6aO35464 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema6aO35464 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema6aO35464 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema6aO35464 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema6aO35464 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema6aO35464 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6aO35464 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6aO35464 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema6aO35464 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema6aO35464 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6aO35464 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6aO35464 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema6aO35464 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6aO35464 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6aO35464 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6aO35464 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6aO35464 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6aO35464 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6aO35464 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema6aO35464 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6aO35464 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema6aO35464 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6aO35464 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6aO35464 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms