Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn1O35350 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn1O35350 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn1O35350 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn1O35350 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn1O35350 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn1O35350 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn1O35350 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn1O35350 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Capn1O35350 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn1O35350 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn1O35350 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn1O35350 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn1O35350 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn1O35350 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn1O35350 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn1O35350 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn1O35350 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn1O35350 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn1O35350 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn1O35350 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn1O35350 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn1O35350 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn1O35350 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn1O35350 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn1O35350 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn1O35350 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn1O35350 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn1O35350 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn1O35350 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn1O35350 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn1O35350 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn1O35350 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn1O35350 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn1O35350 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn1O35350 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn1O35350 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn1O35350 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn1O35350 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn1O35350 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn1O35350 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn1O35350 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn1O35350 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn1O35350 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn1O35350 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn1O35350 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn1O35350 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn1O35350 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn1O35350 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn1O35350 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn1O35350 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn1O35350 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn1O35350 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn1O35350 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn1O35350 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn1O35350 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn1O35350 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn1O35350 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn1O35350 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn1O35350 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn1O35350 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn1O35350 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn1O35350 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn1O35350 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn1O35350 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn1O35350 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn1O35350 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn1O35350 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms