Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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