Protein–RNA interactions for Protein: O09053

Wrn, Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WrnO09053 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
WrnO09053 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
WrnO09053 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
WrnO09053 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
WrnO09053 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
WrnO09053 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
WrnO09053 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
WrnO09053 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
WrnO09053 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
WrnO09053 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
WrnO09053 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
WrnO09053 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
WrnO09053 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
WrnO09053 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
WrnO09053 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
WrnO09053 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
WrnO09053 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
WrnO09053 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
WrnO09053 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
WrnO09053 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
WrnO09053 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
WrnO09053 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
WrnO09053 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
WrnO09053 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
WrnO09053 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
WrnO09053 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
WrnO09053 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
WrnO09053 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
WrnO09053 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
WrnO09053 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
WrnO09053 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
WrnO09053 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
WrnO09053 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
WrnO09053 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
WrnO09053 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
WrnO09053 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
WrnO09053 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
WrnO09053 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
WrnO09053 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
WrnO09053 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
WrnO09053 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
WrnO09053 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
WrnO09053 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
WrnO09053 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
WrnO09053 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
WrnO09053 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
WrnO09053 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
WrnO09053 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
WrnO09053 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
WrnO09053 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
WrnO09053 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
WrnO09053 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
WrnO09053 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
WrnO09053 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
WrnO09053 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
WrnO09053 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
WrnO09053 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
WrnO09053 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
WrnO09053 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
WrnO09053 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
WrnO09053 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
WrnO09053 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
WrnO09053 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
WrnO09053 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
WrnO09053 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
WrnO09053 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
WrnO09053 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
WrnO09053 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
WrnO09053 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
WrnO09053 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
WrnO09053 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
WrnO09053 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
WrnO09053 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
WrnO09053 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
WrnO09053 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
WrnO09053 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
WrnO09053 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
WrnO09053 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
WrnO09053 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
WrnO09053 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
WrnO09053 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
WrnO09053 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
WrnO09053 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
WrnO09053 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
WrnO09053 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
WrnO09053 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
WrnO09053 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.13
WrnO09053 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
WrnO09053 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
WrnO09053 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
WrnO09053 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
WrnO09053 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
WrnO09053 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
WrnO09053 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
WrnO09053 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
WrnO09053 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
WrnO09053 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40.76■■■■■ 4.11
WrnO09053 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
WrnO09053 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
WrnO09053 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms