Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Snap23O09044 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Snap23O09044 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Snap23O09044 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Snap23O09044 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Snap23O09044 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Snap23O09044 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Snap23O09044 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Snap23O09044 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Snap23O09044 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Snap23O09044 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Snap23O09044 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Snap23O09044 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Snap23O09044 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Snap23O09044 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Snap23O09044 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Snap23O09044 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Snap23O09044 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Snap23O09044 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Snap23O09044 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Snap23O09044 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Snap23O09044 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Snap23O09044 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Snap23O09044 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Snap23O09044 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Snap23O09044 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Snap23O09044 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Snap23O09044 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Snap23O09044 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Snap23O09044 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Snap23O09044 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Snap23O09044 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Snap23O09044 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Snap23O09044 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Snap23O09044 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Snap23O09044 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Snap23O09044 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Snap23O09044 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Snap23O09044 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Snap23O09044 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Snap23O09044 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Snap23O09044 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Snap23O09044 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Snap23O09044 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Snap23O09044 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Snap23O09044 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Snap23O09044 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Snap23O09044 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Snap23O09044 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Snap23O09044 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Snap23O09044 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Snap23O09044 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Snap23O09044 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Snap23O09044 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Snap23O09044 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Snap23O09044 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Snap23O09044 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Snap23O09044 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Snap23O09044 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Snap23O09044 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Snap23O09044 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Snap23O09044 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Snap23O09044 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Snap23O09044 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Snap23O09044 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Snap23O09044 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Snap23O09044 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Snap23O09044 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Snap23O09044 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Snap23O09044 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Snap23O09044 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Snap23O09044 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Snap23O09044 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Snap23O09044 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Snap23O09044 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Snap23O09044 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Snap23O09044 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Snap23O09044 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Snap23O09044 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Snap23O09044 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Snap23O09044 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Snap23O09044 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Snap23O09044 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Snap23O09044 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Snap23O09044 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Snap23O09044 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Snap23O09044 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Snap23O09044 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Snap23O09044 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Snap23O09044 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Snap23O09044 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms