Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp35M0QWN7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp35M0QWN7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp35M0QWN7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp35M0QWN7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp35M0QWN7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp35M0QWN7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp35M0QWN7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp35M0QWN7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp35M0QWN7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp35M0QWN7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp35M0QWN7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp35M0QWN7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp35M0QWN7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp35M0QWN7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp35M0QWN7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp35M0QWN7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp35M0QWN7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp35M0QWN7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp35M0QWN7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp35M0QWN7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp35M0QWN7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp35M0QWN7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp35M0QWN7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp35M0QWN7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp35M0QWN7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp35M0QWN7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp35M0QWN7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp35M0QWN7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp35M0QWN7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp35M0QWN7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp35M0QWN7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp35M0QWN7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp35M0QWN7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp35M0QWN7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp35M0QWN7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp35M0QWN7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp35M0QWN7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp35M0QWN7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp35M0QWN7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp35M0QWN7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp35M0QWN7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp35M0QWN7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp35M0QWN7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp35M0QWN7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp35M0QWN7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp35M0QWN7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp35M0QWN7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp35M0QWN7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp35M0QWN7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp35M0QWN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp35M0QWN7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp35M0QWN7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp35M0QWN7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp35M0QWN7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp35M0QWN7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp35M0QWN7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp35M0QWN7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp35M0QWN7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp35M0QWN7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp35M0QWN7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp35M0QWN7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp35M0QWN7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp35M0QWN7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp35M0QWN7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp35M0QWN7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp35M0QWN7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp35M0QWN7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp35M0QWN7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp35M0QWN7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms