Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r80L7N1Z3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r80L7N1Z3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r80L7N1Z3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r80L7N1Z3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r80L7N1Z3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r80L7N1Z3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r80L7N1Z3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r80L7N1Z3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r80L7N1Z3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r80L7N1Z3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r80L7N1Z3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r80L7N1Z3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r80L7N1Z3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r80L7N1Z3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r80L7N1Z3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r80L7N1Z3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r80L7N1Z3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r80L7N1Z3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r80L7N1Z3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r80L7N1Z3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r80L7N1Z3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r80L7N1Z3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r80L7N1Z3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r80L7N1Z3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r80L7N1Z3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r80L7N1Z3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r80L7N1Z3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r80L7N1Z3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r80L7N1Z3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r80L7N1Z3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r80L7N1Z3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r80L7N1Z3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r80L7N1Z3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r80L7N1Z3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r80L7N1Z3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r80L7N1Z3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r80L7N1Z3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r80L7N1Z3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r80L7N1Z3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r80L7N1Z3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r80L7N1Z3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r80L7N1Z3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r80L7N1Z3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r80L7N1Z3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r80L7N1Z3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r80L7N1Z3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r80L7N1Z3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r80L7N1Z3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r80L7N1Z3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r80L7N1Z3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r80L7N1Z3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r80L7N1Z3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r80L7N1Z3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r80L7N1Z3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r80L7N1Z3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r80L7N1Z3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r80L7N1Z3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r80L7N1Z3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r80L7N1Z3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r80L7N1Z3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms