Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smim18J3QNP2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim18J3QNP2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim18J3QNP2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim18J3QNP2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim18J3QNP2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim18J3QNP2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim18J3QNP2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim18J3QNP2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim18J3QNP2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim18J3QNP2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim18J3QNP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim18J3QNP2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim18J3QNP2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim18J3QNP2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim18J3QNP2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim18J3QNP2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smim18J3QNP2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smim18J3QNP2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim18J3QNP2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim18J3QNP2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim18J3QNP2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim18J3QNP2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim18J3QNP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim18J3QNP2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim18J3QNP2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim18J3QNP2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smim18J3QNP2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smim18J3QNP2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smim18J3QNP2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smim18J3QNP2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smim18J3QNP2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smim18J3QNP2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Smim18J3QNP2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smim18J3QNP2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smim18J3QNP2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smim18J3QNP2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim18J3QNP2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim18J3QNP2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim18J3QNP2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim18J3QNP2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smim18J3QNP2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smim18J3QNP2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smim18J3QNP2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim18J3QNP2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim18J3QNP2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim18J3QNP2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim18J3QNP2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smim18J3QNP2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smim18J3QNP2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim18J3QNP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim18J3QNP2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim18J3QNP2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim18J3QNP2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms