Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
Ccdc180J3QNE4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC49.81■■■■■ 5.56
Ccdc180J3QNE4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC49.8■■■■■ 5.56
Ccdc180J3QNE4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC49.8■■■■■ 5.56
Ccdc180J3QNE4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
Ccdc180J3QNE4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC49.77■■■■■ 5.56
Ccdc180J3QNE4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC49.75■■■■■ 5.55
Ccdc180J3QNE4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.73■■■■■ 5.55
Ccdc180J3QNE4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
Ccdc180J3QNE4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC49.67■■■■■ 5.54
Ccdc180J3QNE4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
Ccdc180J3QNE4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC49.65■■■■■ 5.54
Ccdc180J3QNE4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.61■■■■■ 5.53
Ccdc180J3QNE4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
Ccdc180J3QNE4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC49.55■■■■■ 5.52
Ccdc180J3QNE4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
Ccdc180J3QNE4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.46■■■■■ 5.51
Ccdc180J3QNE4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
Ccdc180J3QNE4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
Ccdc180J3QNE4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
Ccdc180J3QNE4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
Ccdc180J3QNE4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
Ccdc180J3QNE4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC49.32■■■■■ 5.49
Ccdc180J3QNE4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
Ccdc180J3QNE4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC49.31■■■■■ 5.48
Ccdc180J3QNE4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
Ccdc180J3QNE4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC49.27■■■■■ 5.48
Ccdc180J3QNE4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
Ccdc180J3QNE4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC49.26■■■■■ 5.48
Ccdc180J3QNE4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
Ccdc180J3QNE4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
Ccdc180J3QNE4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC49.19■■■■■ 5.46
Ccdc180J3QNE4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
Ccdc180J3QNE4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
Ccdc180J3QNE4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC49.1■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Ccdc180J3QNE4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
Ccdc180J3QNE4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC49.02■■■■■ 5.44
Ccdc180J3QNE4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
Ccdc180J3QNE4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
Ccdc180J3QNE4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.97■■■■■ 5.43
Ccdc180J3QNE4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
Ccdc180J3QNE4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
Ccdc180J3QNE4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC48.92■■■■■ 5.42
Ccdc180J3QNE4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC48.9■■■■■ 5.42
Ccdc180J3QNE4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC48.9■■■■■ 5.42
Ccdc180J3QNE4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
Ccdc180J3QNE4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
Ccdc180J3QNE4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
Ccdc180J3QNE4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
Ccdc180J3QNE4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
Ccdc180J3QNE4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Ccdc180J3QNE4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Ccdc180J3QNE4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC48.7■■■■■ 5.39
Ccdc180J3QNE4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.7■■■■■ 5.39
Ccdc180J3QNE4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
Ccdc180J3QNE4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC48.68■■■■■ 5.38
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
Ccdc180J3QNE4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.67■■■■■ 5.38
Ccdc180J3QNE4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.66■■■■■ 5.38
Ccdc180J3QNE4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
Ccdc180J3QNE4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC48.63■■■■■ 5.38
Ccdc180J3QNE4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
Ccdc180J3QNE4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Ccdc180J3QNE4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Ccdc180J3QNE4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC48.53■■■■■ 5.36
Ccdc180J3QNE4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
Ccdc180J3QNE4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
Ccdc180J3QNE4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC48.52■■■■■ 5.36
Ccdc180J3QNE4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
Ccdc180J3QNE4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
Ccdc180J3QNE4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
Ccdc180J3QNE4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
Ccdc180J3QNE4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
Ccdc180J3QNE4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
Ccdc180J3QNE4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
Ccdc180J3QNE4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
Ccdc180J3QNE4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC48.39■■■■■ 5.34
Ccdc180J3QNE4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Ccdc180J3QNE4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.39■■■■■ 5.34
Ccdc180J3QNE4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Ccdc180J3QNE4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
Ccdc180J3QNE4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC48.37■■■■■ 5.33
Ccdc180J3QNE4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Ccdc180J3QNE4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Ccdc180J3QNE4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
Ccdc180J3QNE4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
Ccdc180J3QNE4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
Ccdc180J3QNE4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
Ccdc180J3QNE4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
Ccdc180J3QNE4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms