Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp616J3QN14 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp616J3QN14 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp616J3QN14 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp616J3QN14 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp616J3QN14 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp616J3QN14 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp616J3QN14 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp616J3QN14 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp616J3QN14 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp616J3QN14 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp616J3QN14 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp616J3QN14 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp616J3QN14 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp616J3QN14 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp616J3QN14 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp616J3QN14 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp616J3QN14 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp616J3QN14 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp616J3QN14 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp616J3QN14 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp616J3QN14 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp616J3QN14 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp616J3QN14 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp616J3QN14 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp616J3QN14 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp616J3QN14 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp616J3QN14 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp616J3QN14 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp616J3QN14 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp616J3QN14 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp616J3QN14 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp616J3QN14 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp616J3QN14 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp616J3QN14 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp616J3QN14 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp616J3QN14 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp616J3QN14 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp616J3QN14 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp616J3QN14 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp616J3QN14 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp616J3QN14 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp616J3QN14 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp616J3QN14 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zfp616J3QN14 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp616J3QN14 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp616J3QN14 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp616J3QN14 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp616J3QN14 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp616J3QN14 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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