Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Tubgcp6G5E8P0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Tubgcp6G5E8P0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Tubgcp6G5E8P0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Tubgcp6G5E8P0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Tubgcp6G5E8P0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Tubgcp6G5E8P0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Tubgcp6G5E8P0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Tubgcp6G5E8P0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Tubgcp6G5E8P0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Tubgcp6G5E8P0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Tubgcp6G5E8P0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Tubgcp6G5E8P0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Tubgcp6G5E8P0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Tubgcp6G5E8P0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Tubgcp6G5E8P0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Tubgcp6G5E8P0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Tubgcp6G5E8P0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Tubgcp6G5E8P0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Tubgcp6G5E8P0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Tubgcp6G5E8P0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Tubgcp6G5E8P0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Tubgcp6G5E8P0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Tubgcp6G5E8P0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Tubgcp6G5E8P0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Tubgcp6G5E8P0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Tubgcp6G5E8P0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Tubgcp6G5E8P0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Tubgcp6G5E8P0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Tubgcp6G5E8P0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Tubgcp6G5E8P0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Tubgcp6G5E8P0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Tubgcp6G5E8P0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Tubgcp6G5E8P0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Tubgcp6G5E8P0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Tubgcp6G5E8P0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Tubgcp6G5E8P0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Tubgcp6G5E8P0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Tubgcp6G5E8P0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Tubgcp6G5E8P0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Tubgcp6G5E8P0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Tubgcp6G5E8P0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Tubgcp6G5E8P0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Tubgcp6G5E8P0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Tubgcp6G5E8P0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Tubgcp6G5E8P0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Tubgcp6G5E8P0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Tubgcp6G5E8P0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Tubgcp6G5E8P0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Tubgcp6G5E8P0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Tubgcp6G5E8P0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Tubgcp6G5E8P0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Tubgcp6G5E8P0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Tubgcp6G5E8P0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Tubgcp6G5E8P0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Tubgcp6G5E8P0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Tubgcp6G5E8P0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Tubgcp6G5E8P0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Tubgcp6G5E8P0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Tubgcp6G5E8P0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Tubgcp6G5E8P0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Tubgcp6G5E8P0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC37.45■■■■□ 3.58
Tubgcp6G5E8P0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Tubgcp6G5E8P0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Tubgcp6G5E8P0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Tubgcp6G5E8P0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Tubgcp6G5E8P0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Tubgcp6G5E8P0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Tubgcp6G5E8P0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Tubgcp6G5E8P0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Tubgcp6G5E8P0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Tubgcp6G5E8P0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Tubgcp6G5E8P0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Tubgcp6G5E8P0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Tubgcp6G5E8P0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Tubgcp6G5E8P0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Tubgcp6G5E8P0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Tubgcp6G5E8P0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Tubgcp6G5E8P0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Tubgcp6G5E8P0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Tubgcp6G5E8P0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Tubgcp6G5E8P0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Tubgcp6G5E8P0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Tubgcp6G5E8P0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Tubgcp6G5E8P0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Tubgcp6G5E8P0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Tubgcp6G5E8P0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Tubgcp6G5E8P0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Tubgcp6G5E8P0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Tubgcp6G5E8P0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms