Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
HrcG5E8J6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
HrcG5E8J6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
HrcG5E8J6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
HrcG5E8J6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
HrcG5E8J6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
HrcG5E8J6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
HrcG5E8J6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
HrcG5E8J6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
HrcG5E8J6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
HrcG5E8J6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
HrcG5E8J6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
HrcG5E8J6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
HrcG5E8J6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
HrcG5E8J6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
HrcG5E8J6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
HrcG5E8J6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
HrcG5E8J6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
HrcG5E8J6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
HrcG5E8J6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
HrcG5E8J6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
HrcG5E8J6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
HrcG5E8J6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
HrcG5E8J6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
HrcG5E8J6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
HrcG5E8J6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
HrcG5E8J6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
HrcG5E8J6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
HrcG5E8J6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
HrcG5E8J6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
HrcG5E8J6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
HrcG5E8J6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
HrcG5E8J6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
HrcG5E8J6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
HrcG5E8J6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
HrcG5E8J6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
HrcG5E8J6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
HrcG5E8J6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
HrcG5E8J6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
HrcG5E8J6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
HrcG5E8J6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
HrcG5E8J6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
HrcG5E8J6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
HrcG5E8J6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
HrcG5E8J6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
HrcG5E8J6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
HrcG5E8J6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
HrcG5E8J6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
HrcG5E8J6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
HrcG5E8J6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
HrcG5E8J6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
HrcG5E8J6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
HrcG5E8J6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
HrcG5E8J6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
HrcG5E8J6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
HrcG5E8J6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
HrcG5E8J6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
HrcG5E8J6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.49
HrcG5E8J6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
HrcG5E8J6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
HrcG5E8J6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
HrcG5E8J6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
HrcG5E8J6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
HrcG5E8J6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
HrcG5E8J6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HrcG5E8J6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HrcG5E8J6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HrcG5E8J6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HrcG5E8J6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HrcG5E8J6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HrcG5E8J6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
HrcG5E8J6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
HrcG5E8J6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
HrcG5E8J6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
HrcG5E8J6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
HrcG5E8J6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
HrcG5E8J6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
HrcG5E8J6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
HrcG5E8J6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
HrcG5E8J6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
HrcG5E8J6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
HrcG5E8J6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
HrcG5E8J6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
HrcG5E8J6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC42.81■■■■■ 4.44
HrcG5E8J6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
HrcG5E8J6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
HrcG5E8J6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
HrcG5E8J6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
HrcG5E8J6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
HrcG5E8J6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
HrcG5E8J6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms