Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ScaperF8VQ70 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ScaperF8VQ70 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ScaperF8VQ70 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ScaperF8VQ70 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ScaperF8VQ70 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ScaperF8VQ70 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ScaperF8VQ70 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ScaperF8VQ70 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ScaperF8VQ70 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ScaperF8VQ70 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ScaperF8VQ70 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ScaperF8VQ70 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ScaperF8VQ70 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ScaperF8VQ70 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ScaperF8VQ70 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ScaperF8VQ70 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
ScaperF8VQ70 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ScaperF8VQ70 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ScaperF8VQ70 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ScaperF8VQ70 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ScaperF8VQ70 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ScaperF8VQ70 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ScaperF8VQ70 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ScaperF8VQ70 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ScaperF8VQ70 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ScaperF8VQ70 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ScaperF8VQ70 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ScaperF8VQ70 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ScaperF8VQ70 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ScaperF8VQ70 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ScaperF8VQ70 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ScaperF8VQ70 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ScaperF8VQ70 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ScaperF8VQ70 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ScaperF8VQ70 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ScaperF8VQ70 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ScaperF8VQ70 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ScaperF8VQ70 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ScaperF8VQ70 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ScaperF8VQ70 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ScaperF8VQ70 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ScaperF8VQ70 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ScaperF8VQ70 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ScaperF8VQ70 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ScaperF8VQ70 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ScaperF8VQ70 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ScaperF8VQ70 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ScaperF8VQ70 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ScaperF8VQ70 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ScaperF8VQ70 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ScaperF8VQ70 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ScaperF8VQ70 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ScaperF8VQ70 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ScaperF8VQ70 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ScaperF8VQ70 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ScaperF8VQ70 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ScaperF8VQ70 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ScaperF8VQ70 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ScaperF8VQ70 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ScaperF8VQ70 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ScaperF8VQ70 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ScaperF8VQ70 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ScaperF8VQ70 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ScaperF8VQ70 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ScaperF8VQ70 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ScaperF8VQ70 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ScaperF8VQ70 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ScaperF8VQ70 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ScaperF8VQ70 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ScaperF8VQ70 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ScaperF8VQ70 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ScaperF8VQ70 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ScaperF8VQ70 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ScaperF8VQ70 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ScaperF8VQ70 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ScaperF8VQ70 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ScaperF8VQ70 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ScaperF8VQ70 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ScaperF8VQ70 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ScaperF8VQ70 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ScaperF8VQ70 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ScaperF8VQ70 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ScaperF8VQ70 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ScaperF8VQ70 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ScaperF8VQ70 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ScaperF8VQ70 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ScaperF8VQ70 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ScaperF8VQ70 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ScaperF8VQ70 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ScaperF8VQ70 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms