Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Farp1F8VPU2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Farp1F8VPU2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Farp1F8VPU2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp1F8VPU2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp1F8VPU2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Farp1F8VPU2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Farp1F8VPU2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Farp1F8VPU2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Farp1F8VPU2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Farp1F8VPU2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Farp1F8VPU2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Farp1F8VPU2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Farp1F8VPU2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Farp1F8VPU2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Farp1F8VPU2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Farp1F8VPU2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Farp1F8VPU2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Farp1F8VPU2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Farp1F8VPU2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Farp1F8VPU2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Farp1F8VPU2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Farp1F8VPU2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Farp1F8VPU2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Farp1F8VPU2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Farp1F8VPU2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Farp1F8VPU2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Farp1F8VPU2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Farp1F8VPU2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Farp1F8VPU2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Farp1F8VPU2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Farp1F8VPU2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Farp1F8VPU2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Farp1F8VPU2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Farp1F8VPU2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Farp1F8VPU2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Farp1F8VPU2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Farp1F8VPU2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Farp1F8VPU2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Farp1F8VPU2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Farp1F8VPU2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Farp1F8VPU2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Farp1F8VPU2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Farp1F8VPU2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Farp1F8VPU2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Farp1F8VPU2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Farp1F8VPU2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Farp1F8VPU2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Farp1F8VPU2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Farp1F8VPU2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Farp1F8VPU2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Farp1F8VPU2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Farp1F8VPU2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Farp1F8VPU2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Farp1F8VPU2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Farp1F8VPU2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Farp1F8VPU2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Farp1F8VPU2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Farp1F8VPU2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Farp1F8VPU2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Farp1F8VPU2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Farp1F8VPU2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms