Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhox13F6YCR7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rhox13F6YCR7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhox13F6YCR7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhox13F6YCR7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhox13F6YCR7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhox13F6YCR7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhox13F6YCR7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhox13F6YCR7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhox13F6YCR7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhox13F6YCR7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhox13F6YCR7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhox13F6YCR7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhox13F6YCR7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhox13F6YCR7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhox13F6YCR7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhox13F6YCR7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhox13F6YCR7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rhox13F6YCR7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rhox13F6YCR7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhox13F6YCR7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhox13F6YCR7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhox13F6YCR7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhox13F6YCR7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhox13F6YCR7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rhox13F6YCR7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox13F6YCR7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox13F6YCR7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhox13F6YCR7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhox13F6YCR7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhox13F6YCR7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhox13F6YCR7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhox13F6YCR7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhox13F6YCR7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhox13F6YCR7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhox13F6YCR7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhox13F6YCR7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhox13F6YCR7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhox13F6YCR7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhox13F6YCR7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhox13F6YCR7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhox13F6YCR7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhox13F6YCR7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhox13F6YCR7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhox13F6YCR7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhox13F6YCR7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhox13F6YCR7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhox13F6YCR7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhox13F6YCR7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhox13F6YCR7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhox13F6YCR7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhox13F6YCR7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rhox13F6YCR7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhox13F6YCR7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhox13F6YCR7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhox13F6YCR7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhox13F6YCR7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhox13F6YCR7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhox13F6YCR7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhox13F6YCR7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhox13F6YCR7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhox13F6YCR7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rhox13F6YCR7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhox13F6YCR7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhox13F6YCR7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhox13F6YCR7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhox13F6YCR7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhox13F6YCR7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhox13F6YCR7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhox13F6YCR7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhox13F6YCR7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox13F6YCR7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhox13F6YCR7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms