Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm8444F6XS56 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm8444F6XS56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm8444F6XS56 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm8444F6XS56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm8444F6XS56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm8444F6XS56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm8444F6XS56 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm8444F6XS56 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm8444F6XS56 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm8444F6XS56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm8444F6XS56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm8444F6XS56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm8444F6XS56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8444F6XS56 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8444F6XS56 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm8444F6XS56 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm8444F6XS56 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm8444F6XS56 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8444F6XS56 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8444F6XS56 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm8444F6XS56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8444F6XS56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm8444F6XS56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm8444F6XS56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8444F6XS56 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8444F6XS56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm8444F6XS56 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8444F6XS56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8444F6XS56 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8444F6XS56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8444F6XS56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8444F6XS56 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm8444F6XS56 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm8444F6XS56 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8444F6XS56 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8444F6XS56 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8444F6XS56 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm8444F6XS56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm8444F6XS56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm8444F6XS56 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm8444F6XS56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm8444F6XS56 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm8444F6XS56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm8444F6XS56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm8444F6XS56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8444F6XS56 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8444F6XS56 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8444F6XS56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8444F6XS56 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8444F6XS56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8444F6XS56 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8444F6XS56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm8444F6XS56 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm8444F6XS56 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8444F6XS56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8444F6XS56 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8444F6XS56 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm8444F6XS56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm8444F6XS56 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm8444F6XS56 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm8444F6XS56 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm8444F6XS56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8444F6XS56 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm8444F6XS56 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm8444F6XS56 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm8444F6XS56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm8444F6XS56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm8444F6XS56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm8444F6XS56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm8444F6XS56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm8444F6XS56 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm8444F6XS56 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm8444F6XS56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms