Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Arhgef5E9Q7D5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Arhgef5E9Q7D5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Arhgef5E9Q7D5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Arhgef5E9Q7D5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Arhgef5E9Q7D5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Arhgef5E9Q7D5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Arhgef5E9Q7D5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Arhgef5E9Q7D5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Arhgef5E9Q7D5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.19■■■■■ 4.5
Arhgef5E9Q7D5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Arhgef5E9Q7D5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Arhgef5E9Q7D5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
Arhgef5E9Q7D5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
Arhgef5E9Q7D5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Arhgef5E9Q7D5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
Arhgef5E9Q7D5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Arhgef5E9Q7D5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Arhgef5E9Q7D5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Arhgef5E9Q7D5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Arhgef5E9Q7D5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Arhgef5E9Q7D5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
Arhgef5E9Q7D5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Arhgef5E9Q7D5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Arhgef5E9Q7D5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Arhgef5E9Q7D5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Arhgef5E9Q7D5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Arhgef5E9Q7D5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Arhgef5E9Q7D5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Arhgef5E9Q7D5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Arhgef5E9Q7D5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Arhgef5E9Q7D5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
Arhgef5E9Q7D5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Arhgef5E9Q7D5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Arhgef5E9Q7D5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.44
Arhgef5E9Q7D5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Arhgef5E9Q7D5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Arhgef5E9Q7D5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Arhgef5E9Q7D5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Arhgef5E9Q7D5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Arhgef5E9Q7D5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Arhgef5E9Q7D5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Arhgef5E9Q7D5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
Arhgef5E9Q7D5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Arhgef5E9Q7D5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Arhgef5E9Q7D5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Arhgef5E9Q7D5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Arhgef5E9Q7D5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Arhgef5E9Q7D5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Arhgef5E9Q7D5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
Arhgef5E9Q7D5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Arhgef5E9Q7D5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Arhgef5E9Q7D5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Arhgef5E9Q7D5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Arhgef5E9Q7D5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Arhgef5E9Q7D5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Arhgef5E9Q7D5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Arhgef5E9Q7D5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Arhgef5E9Q7D5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Arhgef5E9Q7D5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Arhgef5E9Q7D5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Arhgef5E9Q7D5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Arhgef5E9Q7D5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Arhgef5E9Q7D5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Arhgef5E9Q7D5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
Arhgef5E9Q7D5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Arhgef5E9Q7D5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Arhgef5E9Q7D5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Arhgef5E9Q7D5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Arhgef5E9Q7D5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Arhgef5E9Q7D5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Arhgef5E9Q7D5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
Arhgef5E9Q7D5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Arhgef5E9Q7D5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Arhgef5E9Q7D5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Arhgef5E9Q7D5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Arhgef5E9Q7D5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Arhgef5E9Q7D5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Arhgef5E9Q7D5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Arhgef5E9Q7D5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Arhgef5E9Q7D5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Arhgef5E9Q7D5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Arhgef5E9Q7D5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Arhgef5E9Q7D5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
Arhgef5E9Q7D5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Arhgef5E9Q7D5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Arhgef5E9Q7D5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Arhgef5E9Q7D5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
Arhgef5E9Q7D5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Arhgef5E9Q7D5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Arhgef5E9Q7D5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Arhgef5E9Q7D5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Arhgef5E9Q7D5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Arhgef5E9Q7D5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Arhgef5E9Q7D5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Arhgef5E9Q7D5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Arhgef5E9Q7D5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
Arhgef5E9Q7D5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Arhgef5E9Q7D5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Arhgef5E9Q7D5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms