Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trip11E9Q512 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trip11E9Q512 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trip11E9Q512 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trip11E9Q512 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trip11E9Q512 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Trip11E9Q512 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trip11E9Q512 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trip11E9Q512 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trip11E9Q512 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trip11E9Q512 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trip11E9Q512 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trip11E9Q512 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trip11E9Q512 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trip11E9Q512 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trip11E9Q512 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trip11E9Q512 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trip11E9Q512 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trip11E9Q512 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trip11E9Q512 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trip11E9Q512 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trip11E9Q512 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trip11E9Q512 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trip11E9Q512 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trip11E9Q512 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trip11E9Q512 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trip11E9Q512 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trip11E9Q512 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trip11E9Q512 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trip11E9Q512 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trip11E9Q512 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trip11E9Q512 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Trip11E9Q512 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trip11E9Q512 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trip11E9Q512 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trip11E9Q512 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trip11E9Q512 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trip11E9Q512 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trip11E9Q512 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trip11E9Q512 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trip11E9Q512 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trip11E9Q512 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trip11E9Q512 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trip11E9Q512 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trip11E9Q512 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trip11E9Q512 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trip11E9Q512 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trip11E9Q512 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trip11E9Q512 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trip11E9Q512 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trip11E9Q512 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trip11E9Q512 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trip11E9Q512 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Trip11E9Q512 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trip11E9Q512 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trip11E9Q512 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trip11E9Q512 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trip11E9Q512 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trip11E9Q512 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trip11E9Q512 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trip11E9Q512 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trip11E9Q512 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trip11E9Q512 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trip11E9Q512 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trip11E9Q512 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trip11E9Q512 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trip11E9Q512 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms