Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Speer4f2E9Q366 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Speer4f2E9Q366 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4f2E9Q366 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4f2E9Q366 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4f2E9Q366 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4f2E9Q366 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4f2E9Q366 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Speer4f2E9Q366 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4f2E9Q366 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4f2E9Q366 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4f2E9Q366 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4f2E9Q366 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4f2E9Q366 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4f2E9Q366 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4f2E9Q366 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4f2E9Q366 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4f2E9Q366 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4f2E9Q366 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4f2E9Q366 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4f2E9Q366 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4f2E9Q366 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Speer4f2E9Q366 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4f2E9Q366 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4f2E9Q366 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4f2E9Q366 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f2E9Q366 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4f2E9Q366 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4f2E9Q366 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4f2E9Q366 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4f2E9Q366 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f2E9Q366 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4f2E9Q366 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Speer4f2E9Q366 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Speer4f2E9Q366 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Speer4f2E9Q366 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4f2E9Q366 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Speer4f2E9Q366 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f2E9Q366 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Speer4f2E9Q366 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4f2E9Q366 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4f2E9Q366 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Speer4f2E9Q366 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Speer4f2E9Q366 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4f2E9Q366 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Speer4f2E9Q366 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f2E9Q366 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f2E9Q366 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Speer4f2E9Q366 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4f2E9Q366 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4f2E9Q366 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4f2E9Q366 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4f2E9Q366 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4f2E9Q366 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4f2E9Q366 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Speer4f2E9Q366 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4f2E9Q366 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4f2E9Q366 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4f2E9Q366 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4f2E9Q366 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4f2E9Q366 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4f2E9Q366 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4f2E9Q366 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f2E9Q366 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f2E9Q366 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f2E9Q366 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f2E9Q366 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4f2E9Q366 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4f2E9Q366 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4f2E9Q366 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4f2E9Q366 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4f2E9Q366 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4f2E9Q366 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4f2E9Q366 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4f2E9Q366 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4f2E9Q366 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4f2E9Q366 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4f2E9Q366 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4f2E9Q366 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4f2E9Q366 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms