Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ddx60E9PZQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ddx60E9PZQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ddx60E9PZQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ddx60E9PZQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Ddx60E9PZQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ddx60E9PZQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ddx60E9PZQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ddx60E9PZQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ddx60E9PZQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ddx60E9PZQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ddx60E9PZQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ddx60E9PZQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ddx60E9PZQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ddx60E9PZQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ddx60E9PZQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ddx60E9PZQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ddx60E9PZQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ddx60E9PZQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ddx60E9PZQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ddx60E9PZQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ddx60E9PZQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ddx60E9PZQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ddx60E9PZQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ddx60E9PZQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ddx60E9PZQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Ddx60E9PZQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ddx60E9PZQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ddx60E9PZQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ddx60E9PZQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ddx60E9PZQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ddx60E9PZQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ddx60E9PZQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ddx60E9PZQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ddx60E9PZQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ddx60E9PZQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ddx60E9PZQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ddx60E9PZQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ddx60E9PZQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ddx60E9PZQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ddx60E9PZQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ddx60E9PZQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.14■■■□□ 2.89
Ddx60E9PZQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ddx60E9PZQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ddx60E9PZQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ddx60E9PZQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ddx60E9PZQ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ddx60E9PZQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ddx60E9PZQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ddx60E9PZQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ddx60E9PZQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ddx60E9PZQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ddx60E9PZQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ddx60E9PZQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ddx60E9PZQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ddx60E9PZQ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ddx60E9PZQ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ddx60E9PZQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ddx60E9PZQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ddx60E9PZQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ddx60E9PZQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ddx60E9PZQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ddx60E9PZQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ddx60E9PZQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ddx60E9PZQ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ddx60E9PZQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ddx60E9PZQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ddx60E9PZQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ddx60E9PZQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ddx60E9PZQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ddx60E9PZQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ddx60E9PZQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ddx60E9PZQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ddx60E9PZQ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ddx60E9PZQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ddx60E9PZQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ddx60E9PZQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ddx60E9PZQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
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