Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfta2E9PXB6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfta2E9PXB6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfta2E9PXB6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms