Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dchs1E9PVD3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dchs1E9PVD3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dchs1E9PVD3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dchs1E9PVD3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dchs1E9PVD3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dchs1E9PVD3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dchs1E9PVD3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dchs1E9PVD3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dchs1E9PVD3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dchs1E9PVD3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dchs1E9PVD3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dchs1E9PVD3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Dchs1E9PVD3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dchs1E9PVD3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dchs1E9PVD3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dchs1E9PVD3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dchs1E9PVD3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dchs1E9PVD3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dchs1E9PVD3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dchs1E9PVD3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Dchs1E9PVD3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dchs1E9PVD3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dchs1E9PVD3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dchs1E9PVD3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dchs1E9PVD3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dchs1E9PVD3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dchs1E9PVD3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dchs1E9PVD3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dchs1E9PVD3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dchs1E9PVD3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dchs1E9PVD3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dchs1E9PVD3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dchs1E9PVD3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dchs1E9PVD3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dchs1E9PVD3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dchs1E9PVD3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dchs1E9PVD3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dchs1E9PVD3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dchs1E9PVD3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dchs1E9PVD3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dchs1E9PVD3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dchs1E9PVD3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dchs1E9PVD3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dchs1E9PVD3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dchs1E9PVD3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Dchs1E9PVD3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dchs1E9PVD3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dchs1E9PVD3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dchs1E9PVD3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dchs1E9PVD3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dchs1E9PVD3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dchs1E9PVD3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dchs1E9PVD3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dchs1E9PVD3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dchs1E9PVD3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dchs1E9PVD3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dchs1E9PVD3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dchs1E9PVD3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dchs1E9PVD3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dchs1E9PVD3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dchs1E9PVD3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dchs1E9PVD3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dchs1E9PVD3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dchs1E9PVD3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dchs1E9PVD3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dchs1E9PVD3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms