Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit3bE9PV48 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit3bE9PV48 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit3bE9PV48 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifit3bE9PV48 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit3bE9PV48 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit3bE9PV48 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit3bE9PV48 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit3bE9PV48 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit3bE9PV48 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifit3bE9PV48 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit3bE9PV48 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit3bE9PV48 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit3bE9PV48 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit3bE9PV48 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifit3bE9PV48 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ifit3bE9PV48 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifit3bE9PV48 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifit3bE9PV48 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifit3bE9PV48 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifit3bE9PV48 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifit3bE9PV48 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifit3bE9PV48 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifit3bE9PV48 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifit3bE9PV48 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifit3bE9PV48 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifit3bE9PV48 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit3bE9PV48 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit3bE9PV48 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifit3bE9PV48 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifit3bE9PV48 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifit3bE9PV48 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit3bE9PV48 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifit3bE9PV48 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifit3bE9PV48 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit3bE9PV48 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifit3bE9PV48 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifit3bE9PV48 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifit3bE9PV48 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifit3bE9PV48 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit3bE9PV48 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifit3bE9PV48 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifit3bE9PV48 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifit3bE9PV48 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit3bE9PV48 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit3bE9PV48 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit3bE9PV48 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit3bE9PV48 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit3bE9PV48 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit3bE9PV48 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit3bE9PV48 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit3bE9PV48 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit3bE9PV48 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit3bE9PV48 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifit3bE9PV48 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit3bE9PV48 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit3bE9PV48 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifit3bE9PV48 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifit3bE9PV48 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifit3bE9PV48 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifit3bE9PV48 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifit3bE9PV48 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifit3bE9PV48 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifit3bE9PV48 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifit3bE9PV48 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifit3bE9PV48 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifit3bE9PV48 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifit3bE9PV48 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifit3bE9PV48 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifit3bE9PV48 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifit3bE9PV48 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifit3bE9PV48 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms