Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm10110D3Z5M2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm10110D3Z5M2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm10110D3Z5M2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm10110D3Z5M2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm10110D3Z5M2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gm10110D3Z5M2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm10110D3Z5M2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm10110D3Z5M2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm10110D3Z5M2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm10110D3Z5M2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm10110D3Z5M2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm10110D3Z5M2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm10110D3Z5M2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm10110D3Z5M2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm10110D3Z5M2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm10110D3Z5M2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm10110D3Z5M2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm10110D3Z5M2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm10110D3Z5M2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm10110D3Z5M2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm10110D3Z5M2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm10110D3Z5M2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm10110D3Z5M2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm10110D3Z5M2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm10110D3Z5M2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm10110D3Z5M2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm10110D3Z5M2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm10110D3Z5M2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm10110D3Z5M2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm10110D3Z5M2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm10110D3Z5M2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gm10110D3Z5M2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm10110D3Z5M2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm10110D3Z5M2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm10110D3Z5M2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm10110D3Z5M2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm10110D3Z5M2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm10110D3Z5M2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm10110D3Z5M2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm10110D3Z5M2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm10110D3Z5M2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gm10110D3Z5M2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gm10110D3Z5M2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm10110D3Z5M2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm10110D3Z5M2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm10110D3Z5M2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm10110D3Z5M2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm10110D3Z5M2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm10110D3Z5M2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm10110D3Z5M2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm10110D3Z5M2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm10110D3Z5M2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10110D3Z5M2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10110D3Z5M2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm10110D3Z5M2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm10110D3Z5M2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm10110D3Z5M2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm10110D3Z5M2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm10110D3Z5M2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm10110D3Z5M2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm10110D3Z5M2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm10110D3Z5M2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm10110D3Z5M2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm10110D3Z5M2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10110D3Z5M2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10110D3Z5M2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm10110D3Z5M2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10110D3Z5M2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm10110D3Z5M2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm10110D3Z5M2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm10110D3Z5M2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms