Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calhm1D3Z291 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calhm1D3Z291 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calhm1D3Z291 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calhm1D3Z291 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calhm1D3Z291 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calhm1D3Z291 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm1D3Z291 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calhm1D3Z291 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calhm1D3Z291 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calhm1D3Z291 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calhm1D3Z291 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calhm1D3Z291 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calhm1D3Z291 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calhm1D3Z291 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calhm1D3Z291 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calhm1D3Z291 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calhm1D3Z291 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calhm1D3Z291 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calhm1D3Z291 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calhm1D3Z291 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calhm1D3Z291 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calhm1D3Z291 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calhm1D3Z291 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Calhm1D3Z291 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calhm1D3Z291 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Calhm1D3Z291 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Calhm1D3Z291 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Calhm1D3Z291 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calhm1D3Z291 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Calhm1D3Z291 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Calhm1D3Z291 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Calhm1D3Z291 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calhm1D3Z291 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calhm1D3Z291 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calhm1D3Z291 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calhm1D3Z291 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calhm1D3Z291 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calhm1D3Z291 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calhm1D3Z291 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm1D3Z291 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm1D3Z291 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calhm1D3Z291 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calhm1D3Z291 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calhm1D3Z291 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calhm1D3Z291 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calhm1D3Z291 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calhm1D3Z291 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm1D3Z291 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm1D3Z291 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calhm1D3Z291 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms