Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa28D3Z1V9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa28D3Z1V9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa28D3Z1V9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa28D3Z1V9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa28D3Z1V9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa28D3Z1V9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa28D3Z1V9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa28D3Z1V9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa28D3Z1V9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa28D3Z1V9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa28D3Z1V9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa28D3Z1V9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa28D3Z1V9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa28D3Z1V9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa28D3Z1V9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa28D3Z1V9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa28D3Z1V9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa28D3Z1V9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa28D3Z1V9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa28D3Z1V9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa28D3Z1V9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa28D3Z1V9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa28D3Z1V9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa28D3Z1V9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa28D3Z1V9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defa28D3Z1V9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa28D3Z1V9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa28D3Z1V9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa28D3Z1V9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa28D3Z1V9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms