Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm4871D3Z0W7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm4871D3Z0W7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm4871D3Z0W7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm4871D3Z0W7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm4871D3Z0W7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm4871D3Z0W7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm4871D3Z0W7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm4871D3Z0W7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm4871D3Z0W7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm4871D3Z0W7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm4871D3Z0W7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm4871D3Z0W7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm4871D3Z0W7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm4871D3Z0W7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm4871D3Z0W7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm4871D3Z0W7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm4871D3Z0W7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm4871D3Z0W7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4871D3Z0W7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4871D3Z0W7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4871D3Z0W7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4871D3Z0W7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4871D3Z0W7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm4871D3Z0W7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm4871D3Z0W7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm4871D3Z0W7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm4871D3Z0W7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm4871D3Z0W7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm4871D3Z0W7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm4871D3Z0W7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm4871D3Z0W7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm4871D3Z0W7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm4871D3Z0W7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm4871D3Z0W7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm4871D3Z0W7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm4871D3Z0W7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gm4871D3Z0W7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm4871D3Z0W7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm4871D3Z0W7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm4871D3Z0W7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm4871D3Z0W7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm4871D3Z0W7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm4871D3Z0W7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm4871D3Z0W7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm4871D3Z0W7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm4871D3Z0W7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm4871D3Z0W7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4871D3Z0W7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm4871D3Z0W7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm4871D3Z0W7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm4871D3Z0W7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm4871D3Z0W7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm4871D3Z0W7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm4871D3Z0W7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm4871D3Z0W7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4871D3Z0W7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4871D3Z0W7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm4871D3Z0W7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4871D3Z0W7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4871D3Z0W7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm4871D3Z0W7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm4871D3Z0W7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm4871D3Z0W7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm4871D3Z0W7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm4871D3Z0W7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm4871D3Z0W7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm4871D3Z0W7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm4871D3Z0W7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm4871D3Z0W7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm4871D3Z0W7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm4871D3Z0W7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms