Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc13D3YV10 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc13D3YV10 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc13D3YV10 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc13D3YV10 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc13D3YV10 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc13D3YV10 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc13D3YV10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc13D3YV10 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc13D3YV10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc13D3YV10 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc13D3YV10 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc13D3YV10 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc13D3YV10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc13D3YV10 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc13D3YV10 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc13D3YV10 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc13D3YV10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc13D3YV10 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc13D3YV10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc13D3YV10 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc13D3YV10 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc13D3YV10 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc13D3YV10 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc13D3YV10 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc13D3YV10 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc13D3YV10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc13D3YV10 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc13D3YV10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc13D3YV10 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc13D3YV10 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc13D3YV10 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc13D3YV10 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc13D3YV10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc13D3YV10 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc13D3YV10 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc13D3YV10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc13D3YV10 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc13D3YV10 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc13D3YV10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc13D3YV10 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc13D3YV10 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc13D3YV10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc13D3YV10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc13D3YV10 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc13D3YV10 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc13D3YV10 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc13D3YV10 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc13D3YV10 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc13D3YV10 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc13D3YV10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc13D3YV10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc13D3YV10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc13D3YV10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc13D3YV10 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc13D3YV10 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc13D3YV10 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc13D3YV10 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc13D3YV10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc13D3YV10 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc13D3YV10 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc13D3YV10 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc13D3YV10 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc13D3YV10 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc13D3YV10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc13D3YV10 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms