Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4950D3YUM8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4950D3YUM8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4950D3YUM8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4950D3YUM8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4950D3YUM8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4950D3YUM8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4950D3YUM8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4950D3YUM8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4950D3YUM8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4950D3YUM8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4950D3YUM8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm4950D3YUM8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4950D3YUM8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4950D3YUM8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4950D3YUM8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4950D3YUM8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4950D3YUM8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4950D3YUM8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4950D3YUM8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4950D3YUM8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4950D3YUM8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4950D3YUM8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm4950D3YUM8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm4950D3YUM8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm4950D3YUM8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm4950D3YUM8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm4950D3YUM8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm4950D3YUM8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm4950D3YUM8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4950D3YUM8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4950D3YUM8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4950D3YUM8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm4950D3YUM8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm4950D3YUM8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm4950D3YUM8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm4950D3YUM8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm4950D3YUM8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm4950D3YUM8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm4950D3YUM8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm4950D3YUM8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm4950D3YUM8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm4950D3YUM8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm4950D3YUM8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm4950D3YUM8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm4950D3YUM8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm4950D3YUM8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4950D3YUM8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4950D3YUM8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4950D3YUM8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm4950D3YUM8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm4950D3YUM8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4950D3YUM8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4950D3YUM8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm4950D3YUM8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm4950D3YUM8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm4950D3YUM8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm4950D3YUM8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm4950D3YUM8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm4950D3YUM8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm4950D3YUM8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm4950D3YUM8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm4950D3YUM8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm4950D3YUM8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm4950D3YUM8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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