Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2d4D3YUH6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2d4D3YUH6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2d4D3YUH6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d4D3YUH6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d4D3YUH6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2d4D3YUH6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2d4D3YUH6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2d4D3YUH6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2d4D3YUH6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2d4D3YUH6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2d4D3YUH6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2d4D3YUH6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d4D3YUH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2d4D3YUH6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2d4D3YUH6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2d4D3YUH6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ube2d4D3YUH6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d4D3YUH6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d4D3YUH6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d4D3YUH6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2d4D3YUH6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2d4D3YUH6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms