Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mterf1bB9EJ57 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mterf1bB9EJ57 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mterf1bB9EJ57 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mterf1bB9EJ57 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mterf1bB9EJ57 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mterf1bB9EJ57 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mterf1bB9EJ57 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Mterf1bB9EJ57 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mterf1bB9EJ57 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mterf1bB9EJ57 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mterf1bB9EJ57 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mterf1bB9EJ57 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mterf1bB9EJ57 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mterf1bB9EJ57 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mterf1bB9EJ57 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mterf1bB9EJ57 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mterf1bB9EJ57 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mterf1bB9EJ57 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mterf1bB9EJ57 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mterf1bB9EJ57 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mterf1bB9EJ57 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mterf1bB9EJ57 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mterf1bB9EJ57 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mterf1bB9EJ57 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mterf1bB9EJ57 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mterf1bB9EJ57 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mterf1bB9EJ57 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mterf1bB9EJ57 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mterf1bB9EJ57 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mterf1bB9EJ57 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mterf1bB9EJ57 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mterf1bB9EJ57 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mterf1bB9EJ57 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mterf1bB9EJ57 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mterf1bB9EJ57 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mterf1bB9EJ57 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mterf1bB9EJ57 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mterf1bB9EJ57 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mterf1bB9EJ57 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mterf1bB9EJ57 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mterf1bB9EJ57 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mterf1bB9EJ57 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mterf1bB9EJ57 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mterf1bB9EJ57 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mterf1bB9EJ57 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mterf1bB9EJ57 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mterf1bB9EJ57 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mterf1bB9EJ57 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mterf1bB9EJ57 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mterf1bB9EJ57 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mterf1bB9EJ57 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mterf1bB9EJ57 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mterf1bB9EJ57 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mterf1bB9EJ57 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mterf1bB9EJ57 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mterf1bB9EJ57 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mterf1bB9EJ57 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms