Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hbb-bh2B2RVB7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hbb-bh2B2RVB7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hbb-bh2B2RVB7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hbb-bh2B2RVB7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hbb-bh2B2RVB7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hbb-bh2B2RVB7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hbb-bh2B2RVB7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hbb-bh2B2RVB7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hbb-bh2B2RVB7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hbb-bh2B2RVB7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hbb-bh2B2RVB7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hbb-bh2B2RVB7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hbb-bh2B2RVB7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hbb-bh2B2RVB7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hbb-bh2B2RVB7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hbb-bh2B2RVB7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hbb-bh2B2RVB7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hbb-bh2B2RVB7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hbb-bh2B2RVB7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hbb-bh2B2RVB7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hbb-bh2B2RVB7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hbb-bh2B2RVB7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hbb-bh2B2RVB7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hbb-bh2B2RVB7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hbb-bh2B2RVB7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hbb-bh2B2RVB7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hbb-bh2B2RVB7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hbb-bh2B2RVB7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms