Protein–RNA interactions for Protein: B2RV46

Spata6l, Spermatogenesis associated 6-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6lB2RV46 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata6lB2RV46 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata6lB2RV46 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata6lB2RV46 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata6lB2RV46 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata6lB2RV46 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata6lB2RV46 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata6lB2RV46 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata6lB2RV46 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spata6lB2RV46 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spata6lB2RV46 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata6lB2RV46 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata6lB2RV46 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata6lB2RV46 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata6lB2RV46 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata6lB2RV46 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata6lB2RV46 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata6lB2RV46 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata6lB2RV46 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spata6lB2RV46 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spata6lB2RV46 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spata6lB2RV46 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata6lB2RV46 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata6lB2RV46 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata6lB2RV46 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata6lB2RV46 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata6lB2RV46 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata6lB2RV46 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata6lB2RV46 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata6lB2RV46 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata6lB2RV46 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spata6lB2RV46 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spata6lB2RV46 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata6lB2RV46 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata6lB2RV46 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spata6lB2RV46 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata6lB2RV46 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata6lB2RV46 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Spata6lB2RV46 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spata6lB2RV46 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spata6lB2RV46 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spata6lB2RV46 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spata6lB2RV46 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Spata6lB2RV46 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spata6lB2RV46 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata6lB2RV46 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata6lB2RV46 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spata6lB2RV46 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata6lB2RV46 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spata6lB2RV46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Spata6lB2RV46 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata6lB2RV46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata6lB2RV46 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spata6lB2RV46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spata6lB2RV46 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spata6lB2RV46 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spata6lB2RV46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spata6lB2RV46 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spata6lB2RV46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spata6lB2RV46 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spata6lB2RV46 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spata6lB2RV46 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spata6lB2RV46 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata6lB2RV46 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spata6lB2RV46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spata6lB2RV46 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms