Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud4B2RRE7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud4B2RRE7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud4B2RRE7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud4B2RRE7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud4B2RRE7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud4B2RRE7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud4B2RRE7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud4B2RRE7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud4B2RRE7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud4B2RRE7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud4B2RRE7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud4B2RRE7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud4B2RRE7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud4B2RRE7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud4B2RRE7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud4B2RRE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud4B2RRE7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud4B2RRE7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud4B2RRE7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud4B2RRE7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud4B2RRE7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud4B2RRE7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud4B2RRE7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud4B2RRE7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otud4B2RRE7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud4B2RRE7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud4B2RRE7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otud4B2RRE7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otud4B2RRE7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otud4B2RRE7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otud4B2RRE7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otud4B2RRE7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Otud4B2RRE7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud4B2RRE7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud4B2RRE7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otud4B2RRE7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud4B2RRE7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud4B2RRE7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otud4B2RRE7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Otud4B2RRE7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otud4B2RRE7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud4B2RRE7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud4B2RRE7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Otud4B2RRE7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud4B2RRE7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud4B2RRE7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud4B2RRE7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Otud4B2RRE7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otud4B2RRE7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud4B2RRE7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud4B2RRE7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud4B2RRE7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otud4B2RRE7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otud4B2RRE7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otud4B2RRE7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud4B2RRE7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms