Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm438B1ASB3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm438B1ASB3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm438B1ASB3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm438B1ASB3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm438B1ASB3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm438B1ASB3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm438B1ASB3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm438B1ASB3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm438B1ASB3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm438B1ASB3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm438B1ASB3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm438B1ASB3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm438B1ASB3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm438B1ASB3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm438B1ASB3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm438B1ASB3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm438B1ASB3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm438B1ASB3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm438B1ASB3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm438B1ASB3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm438B1ASB3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm438B1ASB3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm438B1ASB3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm438B1ASB3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm438B1ASB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gm438B1ASB3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm438B1ASB3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm438B1ASB3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm438B1ASB3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm438B1ASB3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm438B1ASB3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm438B1ASB3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm438B1ASB3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm438B1ASB3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm438B1ASB3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm438B1ASB3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm438B1ASB3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm438B1ASB3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm438B1ASB3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm438B1ASB3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm438B1ASB3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm438B1ASB3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm438B1ASB3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms