Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS4

Gm10406, Alpha7-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10406A6NAS4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm10406A6NAS4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm10406A6NAS4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm10406A6NAS4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm10406A6NAS4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm10406A6NAS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10406A6NAS4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10406A6NAS4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10406A6NAS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10406A6NAS4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm10406A6NAS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10406A6NAS4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10406A6NAS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10406A6NAS4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10406A6NAS4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10406A6NAS4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10406A6NAS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10406A6NAS4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10406A6NAS4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10406A6NAS4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10406A6NAS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10406A6NAS4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10406A6NAS4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10406A6NAS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10406A6NAS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10406A6NAS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10406A6NAS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10406A6NAS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10406A6NAS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10406A6NAS4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10406A6NAS4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10406A6NAS4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10406A6NAS4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10406A6NAS4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10406A6NAS4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10406A6NAS4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10406A6NAS4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm10406A6NAS4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm10406A6NAS4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm10406A6NAS4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm10406A6NAS4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm10406A6NAS4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm10406A6NAS4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm10406A6NAS4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 398.6 ms