Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc9bA3KGF9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc9bA3KGF9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc9bA3KGF9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc9bA3KGF9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9bA3KGF9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc9bA3KGF9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc9bA3KGF9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc9bA3KGF9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc9bA3KGF9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc9bA3KGF9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc9bA3KGF9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc9bA3KGF9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9bA3KGF9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc9bA3KGF9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc9bA3KGF9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc9bA3KGF9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc9bA3KGF9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc9bA3KGF9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9bA3KGF9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc9bA3KGF9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9bA3KGF9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9bA3KGF9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9bA3KGF9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9bA3KGF9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc9bA3KGF9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9bA3KGF9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9bA3KGF9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9bA3KGF9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9bA3KGF9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9bA3KGF9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9bA3KGF9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9bA3KGF9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc9bA3KGF9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc9bA3KGF9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc9bA3KGF9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc9bA3KGF9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9bA3KGF9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc9bA3KGF9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc9bA3KGF9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9bA3KGF9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc9bA3KGF9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc9bA3KGF9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9bA3KGF9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc9bA3KGF9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms