Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pm20d2A3KG59 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pm20d2A3KG59 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pm20d2A3KG59 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pm20d2A3KG59 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pm20d2A3KG59 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pm20d2A3KG59 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pm20d2A3KG59 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pm20d2A3KG59 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pm20d2A3KG59 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pm20d2A3KG59 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pm20d2A3KG59 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pm20d2A3KG59 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pm20d2A3KG59 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pm20d2A3KG59 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pm20d2A3KG59 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pm20d2A3KG59 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pm20d2A3KG59 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pm20d2A3KG59 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pm20d2A3KG59 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pm20d2A3KG59 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pm20d2A3KG59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pm20d2A3KG59 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pm20d2A3KG59 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pm20d2A3KG59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pm20d2A3KG59 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pm20d2A3KG59 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pm20d2A3KG59 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pm20d2A3KG59 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pm20d2A3KG59 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pm20d2A3KG59 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pm20d2A3KG59 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pm20d2A3KG59 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pm20d2A3KG59 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms