Protein–RNA interactions for Protein: A2AWL9

Rhox2c, Reproductive homeobox 2C, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2cA2AWL9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhox2cA2AWL9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rhox2cA2AWL9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhox2cA2AWL9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhox2cA2AWL9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhox2cA2AWL9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhox2cA2AWL9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhox2cA2AWL9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhox2cA2AWL9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhox2cA2AWL9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhox2cA2AWL9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhox2cA2AWL9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhox2cA2AWL9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhox2cA2AWL9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhox2cA2AWL9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rhox2cA2AWL9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rhox2cA2AWL9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rhox2cA2AWL9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rhox2cA2AWL9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhox2cA2AWL9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhox2cA2AWL9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhox2cA2AWL9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhox2cA2AWL9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhox2cA2AWL9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhox2cA2AWL9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhox2cA2AWL9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhox2cA2AWL9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhox2cA2AWL9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhox2cA2AWL9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhox2cA2AWL9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhox2cA2AWL9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhox2cA2AWL9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhox2cA2AWL9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhox2cA2AWL9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhox2cA2AWL9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhox2cA2AWL9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhox2cA2AWL9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhox2cA2AWL9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhox2cA2AWL9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhox2cA2AWL9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhox2cA2AWL9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhox2cA2AWL9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rhox2cA2AWL9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rhox2cA2AWL9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhox2cA2AWL9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhox2cA2AWL9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rhox2cA2AWL9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhox2cA2AWL9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhox2cA2AWL9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhox2cA2AWL9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhox2cA2AWL9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhox2cA2AWL9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox2cA2AWL9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox2cA2AWL9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rhox2cA2AWL9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox2cA2AWL9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhox2cA2AWL9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhox2cA2AWL9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhox2cA2AWL9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhox2cA2AWL9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhox2cA2AWL9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhox2cA2AWL9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rhox2cA2AWL9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhox2cA2AWL9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms