Protein–RNA interactions for Protein: A2AF47

Dock11, Dedicator of cytokinesis protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 2,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dock11A2AF47 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dock11A2AF47 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dock11A2AF47 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dock11A2AF47 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dock11A2AF47 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dock11A2AF47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dock11A2AF47 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dock11A2AF47 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dock11A2AF47 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dock11A2AF47 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dock11A2AF47 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dock11A2AF47 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dock11A2AF47 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dock11A2AF47 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dock11A2AF47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dock11A2AF47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dock11A2AF47 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dock11A2AF47 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dock11A2AF47 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dock11A2AF47 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dock11A2AF47 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dock11A2AF47 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dock11A2AF47 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dock11A2AF47 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dock11A2AF47 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dock11A2AF47 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dock11A2AF47 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dock11A2AF47 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dock11A2AF47 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dock11A2AF47 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dock11A2AF47 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dock11A2AF47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dock11A2AF47 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dock11A2AF47 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dock11A2AF47 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dock11A2AF47 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dock11A2AF47 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dock11A2AF47 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dock11A2AF47 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dock11A2AF47 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dock11A2AF47 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dock11A2AF47 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dock11A2AF47 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dock11A2AF47 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dock11A2AF47 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dock11A2AF47 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dock11A2AF47 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dock11A2AF47 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dock11A2AF47 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms