Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Larp1bA0A0A6YXJ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Larp1bA0A0A6YXJ7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Larp1bA0A0A6YXJ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Larp1bA0A0A6YXJ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Larp1bA0A0A6YXJ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Larp1bA0A0A6YXJ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Larp1bA0A0A6YXJ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Larp1bA0A0A6YXJ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Larp1bA0A0A6YXJ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Larp1bA0A0A6YXJ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Larp1bA0A0A6YXJ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Larp1bA0A0A6YXJ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Larp1bA0A0A6YXJ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms