Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv3-4A0A0A6YXF1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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