Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQY2

2410004P03Rik, RIKEN cDNA 2410004P03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2410004P03RikA0A087WQY2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
2410004P03RikA0A087WQY2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
2410004P03RikA0A087WQY2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
2410004P03RikA0A087WQY2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
2410004P03RikA0A087WQY2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
2410004P03RikA0A087WQY2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
2410004P03RikA0A087WQY2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
2410004P03RikA0A087WQY2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
2410004P03RikA0A087WQY2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
2410004P03RikA0A087WQY2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2410004P03RikA0A087WQY2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2410004P03RikA0A087WQY2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
2410004P03RikA0A087WQY2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
2410004P03RikA0A087WQY2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
2410004P03RikA0A087WQY2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
2410004P03RikA0A087WQY2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
2410004P03RikA0A087WQY2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
2410004P03RikA0A087WQY2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
2410004P03RikA0A087WQY2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
2410004P03RikA0A087WQY2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
2410004P03RikA0A087WQY2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2410004P03RikA0A087WQY2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2410004P03RikA0A087WQY2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
2410004P03RikA0A087WQY2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2410004P03RikA0A087WQY2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2410004P03RikA0A087WQY2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2410004P03RikA0A087WQY2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2410004P03RikA0A087WQY2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2410004P03RikA0A087WQY2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
2410004P03RikA0A087WQY2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
2410004P03RikA0A087WQY2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2410004P03RikA0A087WQY2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2410004P03RikA0A087WQY2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2410004P03RikA0A087WQY2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
2410004P03RikA0A087WQY2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2410004P03RikA0A087WQY2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
2410004P03RikA0A087WQY2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2410004P03RikA0A087WQY2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2410004P03RikA0A087WQY2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2410004P03RikA0A087WQY2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
2410004P03RikA0A087WQY2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
2410004P03RikA0A087WQY2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
2410004P03RikA0A087WQY2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
2410004P03RikA0A087WQY2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2410004P03RikA0A087WQY2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
2410004P03RikA0A087WQY2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2410004P03RikA0A087WQY2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2410004P03RikA0A087WQY2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2410004P03RikA0A087WQY2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2410004P03RikA0A087WQY2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2410004P03RikA0A087WQY2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
2410004P03RikA0A087WQY2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
2410004P03RikA0A087WQY2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2410004P03RikA0A087WQY2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
2410004P03RikA0A087WQY2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
2410004P03RikA0A087WQY2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
2410004P03RikA0A087WQY2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
2410004P03RikA0A087WQY2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2410004P03RikA0A087WQY2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms