Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ99

Gm29666, Predicted gene 29666, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29666A0A087WQ99 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm29666A0A087WQ99 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm29666A0A087WQ99 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm29666A0A087WQ99 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm29666A0A087WQ99 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm29666A0A087WQ99 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm29666A0A087WQ99 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm29666A0A087WQ99 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm29666A0A087WQ99 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm29666A0A087WQ99 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm29666A0A087WQ99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm29666A0A087WQ99 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm29666A0A087WQ99 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm29666A0A087WQ99 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm29666A0A087WQ99 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm29666A0A087WQ99 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm29666A0A087WQ99 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29666A0A087WQ99 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29666A0A087WQ99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29666A0A087WQ99 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29666A0A087WQ99 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29666A0A087WQ99 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29666A0A087WQ99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29666A0A087WQ99 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29666A0A087WQ99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm29666A0A087WQ99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29666A0A087WQ99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29666A0A087WQ99 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29666A0A087WQ99 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm29666A0A087WQ99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29666A0A087WQ99 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm29666A0A087WQ99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm29666A0A087WQ99 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm29666A0A087WQ99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm29666A0A087WQ99 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29666A0A087WQ99 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm29666A0A087WQ99 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm29666A0A087WQ99 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Gm29666A0A087WQ99 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Gm29666A0A087WQ99 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Gm29666A0A087WQ99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gm29666A0A087WQ99 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm29666A0A087WQ99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm29666A0A087WQ99 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm29666A0A087WQ99 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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