Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNZ6

1700025B11Rik, RIKEN cDNA 1700025B11 gene, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700025B11RikA0A087WNZ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700025B11RikA0A087WNZ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700025B11RikA0A087WNZ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700025B11RikA0A087WNZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700025B11RikA0A087WNZ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700025B11RikA0A087WNZ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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1700025B11RikA0A087WNZ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700025B11RikA0A087WNZ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700025B11RikA0A087WNZ6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700025B11RikA0A087WNZ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700025B11RikA0A087WNZ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700025B11RikA0A087WNZ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700025B11RikA0A087WNZ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700025B11RikA0A087WNZ6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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1700025B11RikA0A087WNZ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700025B11RikA0A087WNZ6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700025B11RikA0A087WNZ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700025B11RikA0A087WNZ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700025B11RikA0A087WNZ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
1700025B11RikA0A087WNZ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700025B11RikA0A087WNZ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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