Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hic1Q9R1Y5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hic1Q9R1Y5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hic1Q9R1Y5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms