Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cry2Q9R194 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry2Q9R194 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry2Q9R194 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry2Q9R194 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.4 ms