Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plod3Q9R0E1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plod3Q9R0E1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plod3Q9R0E1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms