Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dpf1Q9QX66 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dpf1Q9QX66 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dpf1Q9QX66 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms