Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a3Q9JLI2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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